Protein–RNA interactions for Protein: Q80X82

Sympk, Symplekin, mousemouse

Predictions only

Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SympkQ80X82 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SympkQ80X82 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SympkQ80X82 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms