Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Zbed4Q80WQ9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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Zbed4Q80WQ9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed4Q80WQ9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Zbed4Q80WQ9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Zbed4Q80WQ9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Zbed4Q80WQ9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Zbed4Q80WQ9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Zbed4Q80WQ9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Zbed4Q80WQ9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
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Zbed4Q80WQ9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Zbed4Q80WQ9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Zbed4Q80WQ9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed4Q80WQ9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed4Q80WQ9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Zbed4Q80WQ9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Zbed4Q80WQ9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Zbed4Q80WQ9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Zbed4Q80WQ9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms