Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc155Q80VJ8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms