Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep170bQ80U49 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep170bQ80U49 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms