Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NischQ80TM9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NischQ80TM9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
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