Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdc42bpbQ7TT50 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc42bpbQ7TT50 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdc42bpbQ7TT50 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms