Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Atf7ipQ7TT18 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf7ipQ7TT18 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms