Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ube2q1Q7TSS2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ube2q1Q7TSS2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms