Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prrc2bQ7TPM1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prrc2bQ7TPM1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms