Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Shq1Q7TMX5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shq1Q7TMX5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shq1Q7TMX5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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