Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rtn4rl2Q7M6Z0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms