Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Topbp1Q6ZQF0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Topbp1Q6ZQF0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms