Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Efr3bQ6ZQ18 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Efr3bQ6ZQ18 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Efr3bQ6ZQ18 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Efr3bQ6ZQ18 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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Efr3bQ6ZQ18 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Efr3bQ6ZQ18 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Efr3bQ6ZQ18 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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