Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ino80Q6ZPV2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.56
Ino80Q6ZPV2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms