Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc9c1Q6UJY2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms