Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

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Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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Atp2b4Q6Q477 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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Atp2b4Q6Q477 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Atp2b4Q6Q477 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Atp2b4Q6Q477 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Atp2b4Q6Q477 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Atp2b4Q6Q477 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Atp2b4Q6Q477 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp2b4Q6Q477 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atp2b4Q6Q477 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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