Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rad54bQ6PFE3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms