Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gramd2bQ6PEM6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gramd2bQ6PEM6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms