Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp40Q6PE01 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms