Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mfsd13aQ6PDE8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms