Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trak1Q6PD31 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trak1Q6PD31 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trak1Q6PD31 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms