Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC061212Q6P8K3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BC061212Q6P8K3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms