Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PrimpolQ6P1E7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms