Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fndc3bQ6NWW9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fndc3bQ6NWW9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fndc3bQ6NWW9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fndc3bQ6NWW9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fndc3bQ6NWW9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fndc3bQ6NWW9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fndc3bQ6NWW9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fndc3bQ6NWW9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms