Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp140Q6NSQ5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp140Q6NSQ5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp140Q6NSQ5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sp140Q6NSQ5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sp140Q6NSQ5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms