Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pdcd11Q6NS46 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Pdcd11Q6NS46 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms