Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ggnbp1Q6K1E7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ggnbp1Q6K1E7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms