Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ParpbpQ6IRT3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ParpbpQ6IRT3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms