Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt77Q6IFZ6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt77Q6IFZ6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms