Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Carmil1Q6EDY6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Carmil1Q6EDY6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms