Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sv2cQ69ZS6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sv2cQ69ZS6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms