Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdzrn3Q69ZS0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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