Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Jmjd1cQ69ZK6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms