Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ric1Q69ZJ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ric1Q69ZJ7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ric1Q69ZJ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ric1Q69ZJ7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ric1Q69ZJ7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ric1Q69ZJ7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ric1Q69ZJ7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ric1Q69ZJ7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ric1Q69ZJ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ric1Q69ZJ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ric1Q69ZJ7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ric1Q69ZJ7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms