Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF7

Cnnm4, Metal transporter CNNM4, mousemouse

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm4Q69ZF7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnnm4Q69ZF7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm4Q69ZF7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm4Q69ZF7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm4Q69ZF7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnnm4Q69ZF7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm4Q69ZF7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnnm4Q69ZF7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms