Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sptbn2Q68FG2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sptbn2Q68FG2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms