Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sbno1Q689Z5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbno1Q689Z5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms