Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ino80dQ66JY2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms