Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zeb1Q64318 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zeb1Q64318 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Zeb1Q64318 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zeb1Q64318 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms