Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Epha6Q62413 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Epha6Q62413 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms