Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttf1Q62187 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf1Q62187 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttf1Q62187 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttf1Q62187 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ttf1Q62187 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttf1Q62187 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttf1Q62187 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ttf1Q62187 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ttf1Q62187 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ttf1Q62187 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ttf1Q62187 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ttf1Q62187 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Ttf1Q62187 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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