Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ssr4Q62186 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms