Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rbm38Q62176 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rbm38Q62176 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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