Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prkd1Q62101 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prkd1Q62101 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms