Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pcbp2Q61990 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms