Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Itga7Q61738 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Itga7Q61738 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms