Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gli3Q61602 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms