Protein–RNA interactions for Protein: Q61458

Ccnh, Cyclin-H, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnhQ61458 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcnhQ61458 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcnhQ61458 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms