Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usf1Q61069 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usf1Q61069 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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Usf1Q61069 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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