Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms